Институт құрамына   10 зертхана кіреді, олардың әрқайсысы нақты бағыттарға бағытталған: спутниктік және геодинамикалық зерттеулер, төтенше жағдайлардың ғарыштық мониторингі, картография және ГАЖ, литосфералық-ионосфералық процестердің динамикасы, су және қоршаған орта ресурстарын модельдеу, ғарыштық ауа райын диагностикалау және болжау, сондай-ақ ғарыштық жүйелердің сенімділігі.